孔子殺少正卯的事情最早記載在了《荀子》中。 司馬遷著《史記·孔子世家》時，沿用了這種說法。兩者的記載基本一致：魯定公十四年，孔子56歲時，當了魯國的攝相。七天后，就誅殺了魯國大夫、亂政者少正卯。這種說法影響很大，至今仍有人采用。
孔子殺少正卯的四大疑點
許多人對孔子殺少正卯之事卻提出了懷疑。歸納其原因，有以下幾點：一、孔子是主張“仁” 的，“仁”是他整個學說的核心。并且，他明確闡述過“仁” 的含義是“愛人”。另一方面，孔子是反對為政殺人的，怎么會當了七天的魯攝相就大開殺戒呢？二、如果孔子真的殺了少正卯，無論如何都是孔子一生中的大事。《論語》是孔子門人及其再傳弟子集成的一部專門輯錄孔子及門人言行的書，為什么對這件大事只字不提呢？三、據史書記載，魯定公十四年， 齊侯與魯侯會于夾谷，當使上卿相禮。其時，孔子正做司寇。魯國因他知禮，故使他越次而使之，稱為攝相。攝相之相，絕非宰相之相，攝相乃是相禮。相禮就是兩國交往的禮相，與國政無涉。這樣，孔子的職位僅僅是個司寇，根本沒有誅殺大夫之權，怎么能殺掉“魯國聞人”少正卯呢？四、《史記》載：衛靈公“三十八年，孔子來，祿如魯”。衛靈公三十八年就是魯定公十三年，既然孔子已去衛國，俸祿卻同在魯國一樣，怎么會在第二年去誅殺亂政的少正卯呢？《史記》這種記載上的矛盾又如何解釋呢？孔子是否殺過少正卯并非是一個毫無意義的問題，這件事影響到對孔子及其思想的評價。質疑者們提出的疑問，尚未得到令人滿意的解釋，從而使孔子是否殺過少正卯成為一件謎案。相信隨著研究的深入，這個謎底一定會被揭開。